冷凍干燥機依據其結構不同可以分為壓蓋型、普通型、多歧管型、多去管壓蓋型和多歧管普通型等類型，這都是對冷凍干燥機功能的一些改進，增加了它的一些輔助功能。壓蓋型是相對于普通型多了一種真空包裝的功能，多歧管型就是能夠通行對多種物質進行冷凍干燥，提高了干燥的效率。
冷凍干燥機采用干燥室和冷阱分開設計，用硅油作為熱量的傳導介質，既有利于節約能源，還能加快生產速度（配有電加熱化霜），而且還容易清潔。可以根據實驗或者生產的要求是否配置自動壓塞功能。這種干燥機配置靈活，性能優異，節能環保，符合絕大多數的實驗和中試的生產要求。是目前比較先進的干燥機。
那么冷凍干燥機作為凍干設備，使用過程中有一些需要注意的事項，包括：
1、樣品在設備凍干之前首先要進行預凍，樣品必須在固態（結冰狀態）下才能凍干，預凍時間越長凍干效果越好。樣品的體積盡量不要超過樣品瓶體積的1/3。
2、在凍干時如果出現樣品融化現象，并且真空泵及冷阱工作狀態良好的情況下，其原因是真空度不夠，有漏氣的地方。請檢查設備所有的閥門是否關閉，凍干腔與冷阱表面接觸的地方是否密封，必要時清潔冷阱表面及凍干腔的密封圈。
3、定期清潔冷凍干燥機冷阱腔及凍干腔。
4、開機后15分鐘后才可以凍干，目的是先讓冷阱預冷，讓真空泵預熱。這樣才能使冷凍干燥機在一個較好工作狀態工作。
5、凍干結束關閉閥門后，凍干瓶內部與外界相通，待氣壓平衡后即可取下瓶子。
6、定期清潔冷凍干燥機壓縮瓶內部的灰塵，真空泵中油少時要進行加油。
